Python u službi bioinformatike — dva Seven Bridges Genomics meetupa tokom juna u Beogradu

BioTech kompanija Seven Bridges Genomics, o čijim skorim uspesima smo pisali na Startitu, ovog meseca najavljuje dva meetupa na kojima će okupljene, kroz primere, upoznati sa korišćenjem Pythona, kako u bioinformatici i analizi podataka, tako i u razvoju ordeđenih delova SBG platforme.

Analiziranje ljudskog genoma i infrastruktura (23. jun)

Na prvom meetupu, 23. juna, ekipa SBGa predstaviće projekat analize razlike u rezultatima i kvalitetu dva različita izvora genetskih informacija (krv i pljuvačka) nad setom od 20 sekvenciranih genoma i na koji način su koristili Python i prateće biblioteke za analizu rezultata. Takođe, predstaviće i kako koriste Python i koji su bili razlozi za odabir Python-a, kao i određenih Python framework-a za razvoj određenih delova svoje platforme.

Prijavi se →

Haplotipi i Spark (30. jun)

Na drugom meetupu, 30. juna, ekipa će predstaviti način na koji su koristili Python da, koristeći informacije dobijene novom tehnikom sekvenciranja (Target Locus Amplification), brzo i efikasno prototipiziraju i testiraju različite algoritme da mapiraju genetske varijacije na oba haplotipa (specifične grupe gena koju osoba nasleđuje od jednog roditelja), što nije bilo moguće sa prethodnim tehnikama sekvenciranja. Pored toga, predstaviće i način na koji su koristili i integrisali Python i Spark za near-realtime obradu velike količine genetskih informacija.

Prijavi se →

Oba meetupa održaće se u prostorijama kompanije, na adresi Milutina Milankovića 1d u Beogradu. Startit je medijski partner ovih meetupa.